１８４４年，英国伦敦基督教会多次派遣医学传教士进行实地探索、考察，终于在该年２月开设了上海第一家西式医院，称为“中国医院”，为仁济医院的前身。１８４６年，医院迁入当时公共租界近山东路的麦家圈，即现在仁济医院西部的院址，并改名山东路医院，又称“仁济医馆”。至１９３２年，医院已扩建成一座设备较好的六层楼现代化医院，并正式命名为“仁济医院”。医院以“慈善”为名，施诊给药，普济贫病百姓，所以求医者愈来愈多。１９４６年１０月，仁济医院重组了董事会，经过整顿，至解放初期，医院已具一定规模，床位数增至３３３张，并分有特等病房、二等病房、普通病房，适合各种文化层次或经济层次病员需求。仁济医院已是当时上海地区一家完整的综合性医院。
１９５２年１１月，经华东军政委员会卫生部批准，仁济医院为第二医学院附属仁济医院，后在“文革”中几度易名工农兵医院、第三人民医院。至１９８４年１２月恢复原名。１９８５年６月，因上海第二医学院更名为上海第二医科大学，由此，仁济医院也更名为“上海第二医科大学附属仁济医院”，沿用至今。
创建于１８４４年的上海仁济医院，是上海开埠后第一所西医医院，她是我国历史最悠久的综合性西医医院之一，是中国近代医学的摇篮…… １６０年来，医院的规模不断扩大，迅速发展，成为学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。近５年，仁济医院借助浦东全面开发开放的东风，实现了历史性的飞跃。１９９９年１０月，仁济东院建成投入使用。医院现占地面积１４５亩，建筑面积近９万平方米，由东、西二部组成。医院现有核定床位１０００张，在编职工２３００余人，设有行政职能部门１１个、临床科室２９个、医技科室６个、市级研究所３个（消化疾病、风湿疾病、男性疾病）、其他各类医学研究室（中心）１４个、临床诊疗中心１８个。
目前，医院拥有立体定向下微电极刺激仪（细胞刀）、核磁共振仪（ＭＲＩ）、多层螺旋ＣＴ（ＭＳＣＴ）、数字Ｘ线摄片机（ＤＲ）、ＰＥＴ－ＣＴ肿瘤放疗设备、数字减影心血管造影系统（ＤＳＡ）、单光子发射计算机断层检查仪（ＳＰＥＣＴ）、彩色Ｄｏｐｐｌｅｒ诊断仪、流式细胞仪、大型生化分析仪等先进的大型医疗设备。
医院致力于加强与海外医学界的交流合作，目前已与美国、法国、日本等十余个国家和地区的２０多所医学院校建立了学踅涣骱陀押煤献鞴叵怠?２００１年，仁济医院率先推行并通过ＩＳＯ９００１质量认证。２００２年，医院建立“全康涉外医疗中心”；２００３年，医院成立“仁济医疗管理公司”，相继托管了无锡仁德医院等８所医院。
仁济医院党政领导班子坚持党的领导、坚持“三个代表”的重要思想，积极加强两个文明建设，医院已六次荣获“全国卫生系统先进集体”称号，并连续七次获得“上海市文明单位”称号。
１９９９年１０月１８日，占地７８亩、建筑面积４．５万平方米、总投资１．９７亿元的仁济东院建成启用，标志着仁济发展史上的一个新的里程碑。２００４年，东部急诊改造、２００５年将正式启用的３．６万平方米的二期外科大楼等实事工程，为有效缓解浦东人民就医难、住院难状况，改善就医环境再立新功。而崭新的“十一五”规划将以“能代表上海水平、体现现代化要求、设施先进、学科领先、服务优良、智能齐全”为目标，全面整合一、二、三期建设，把仁济医院建成上海市现代化医院。
步入二十一世纪的仁济人将传承仁济悠久的历史，以“仁术济世”为己任，以团结、严谨、务实的精神去续写仁济新篇章，为人民的健康、为创造仁济的明天而奋斗……
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